Η βασική διαφορά μεταξύ στοχοθετημένων και μη στοχοθετημένων πρωτεϊνωμάτων είναι ότι η στοχοθετημένη πρωτεϊνωματική στοχεύει στη μέτρηση της αφθονίας μιας συγκεκριμένης πρωτεΐνης, ενώ η μη στοχευμένη πρωτεϊνωματική δεν στοχεύει σε συγκεκριμένη πρωτεΐνη.

Η πρωτεϊνωματική είναι η μελέτη μεγάλης κλίμακας των πρωτεϊνών, των δομών και των λειτουργιών τους. Μελετά το πλήρες συμπλήρωμα πρωτεΐνης σε κύτταρο, ιστό ή οργανισμό υπό συγκεκριμένες συνθήκες. Υπάρχουν δύο τύποι πρωτεϊομικής ως στοχευμένες πρωτεϊνωματικές και μη στοχευμένες πρωτεϊνωματικές.

ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΟ

1. Επισκόπηση και βασικές διαφορές 2. Τι είναι η στοχοθετημένη πρωτεϊνωματική 3. Τι είναι η μη στοχοθετημένη πρωτεϊνωματική 4. Ομοιότητες μεταξύ στοχοθετημένης και μη στοχοθετημένης πρωτεϊομικής 5. Συγκριτική σύγκριση - Στοχοθετημένη εναντίον μη προσανατολισμένης πρωτεϊομικής σε πίνακες 6. Σύνοψη

Τι είναι η στοχοθετημένη πρωτεϊνωματική;

Όπως υποδεικνύει το όνομά της, η στοχευμένη πρωτεϊνωματική στοχεύει μια συγκεκριμένη πρωτεΐνη ή ένα πεπτίδιο σε ένα σύνθετο μίγμα πρωτεϊνών για ανάλυση. Στη συνέχεια αναλύει την παρουσία και την ποσότητα αυτής της προεπιλεγμένης συγκεκριμένης πρωτεΐνης. Αυτή η μέθοδος είναι δυνατή μόνο για ένα δείγμα ή σε πολλαπλά δείγματα. Αυτή η μέθοδος είναι κατάλληλη ακόμη και για μια συγκεκριμένη ομάδα πρωτεϊνών. Αποφέρει ακριβέστερα, ποσοτικά και ευαίσθητα δεδομένα. Επιπλέον, η φασματομετρία μάζας σε συνδυασμό με στοχοθετημένη πρωτεϊνωματική παράγει ακριβέστερες αξιόπιστες μετρήσεις. Αυτή η μέθοδος χρησιμοποιεί τριπλό τετραπολικό φασματόμετρο μάζας (QQQ) για την ανάλυσή του.

Η στοχοθετημένη πρωτεϊνωματική είναι μια κατάλληλη μέθοδος αν θέλετε να επαληθεύσετε εάν ένας στόχος knockdown είναι πραγματικά χτυπημένος ή όταν θέλετε να ποσοτικοποιήσετε μια συγκεκριμένη πρωτεΐνη / πεπτίδιο στον ορό του αίματος, στο εγκεφαλικό υγρό ή στο κυτταρόλυμα κλπ. Μπορείτε επίσης να το χρησιμοποιήσετε, αν θέλετε για να ελέγξετε αν μια συγκεκριμένη πρωτεΐνη εκφράζεται διαφορικά μεταξύ των δειγμάτων ή κατά τη διάρκεια ενός πειράματος χρονικής πορείας.

Τι είναι η μη στοχευμένη πρωτεϊνωματική;

Η μη στοχευμένη πρωτεϊνωματική, όπως αναφέρει το όνομα, δεν στοχεύει σε συγκεκριμένη πρωτεΐνη ή πεπτίδιο για την ανάλυσή της. Η πρωτεϊνωματική ανακάλυψη είναι ένα άλλο όνομα για μη προσανατολισμένη πρωτεϊνωματική. Στην πραγματικότητα, είναι μια πιο «παγκόσμια» ανάλυση. Γενικά, η εκτέλεση μη στοχευμένων πρωτεϊνωμάτων είναι η απάντηση στην ερώτηση "ποια πρωτεΐνη ή πρωτεΐνες υπάρχουν σε αυτό το δείγμα ή πολλαπλά δείγματα;". Αυτή η μέθοδος δεν είναι ευαίσθητη ως στοχοθετημένη πρωτεϊνωματική. Αλλά μπορεί να εντοπίσει και να μετρήσει πολλές πρωτεΐνες συμπεριλαμβανομένων των νέων πρωτεϊνών. Οι μη προσανατολισμένες πρωτεϊνωμάτες μπορούν να παράγουν τόσο ποσοτικές όσο και ποιοτικές μετρήσεις.

Ποιες είναι οι ομοιότητες μεταξύ στοχοθετημένων και μη στοχευμένων πρωτεϊνωμάτων;

  • Τόσο οι στοχευμένες όσο και οι μη στοχοθετημένες πρωτεΐνες μετράνε τις πρωτεΐνες στα δείγματα Είναι σημαντικές στην ανάλυση πρωτεόνης. Αυτές οι μέθοδοι χρησιμοποιούν φασματομετρία μάζας.

Ποια είναι η διαφορά μεταξύ στοχοθετημένης και μη στοχευμένης πρωτεϊνωμικής;

Πρώτον, η στοχευμένη πρωτεϊνωματική είναι ο προσδιορισμός της παρουσίας και της ποσότητας μιας συγκεκριμένης πρωτεΐνης ή πεπτιδίου σε σύνθετο μείγμα πρωτεϊνών. Αντίθετα, η μη στοχοθετημένη πρωτεϊνωματική είναι η ποσοτική και ποιοτική μελέτη των πρωτεϊνών που υπάρχουν σε ένα δείγμα ή δείγματα χωρίς να στοχεύει μια συγκεκριμένη πρωτεΐνη. Στοχευμένες πρωτεϊνωματικές διεργασίες πραγματοποιούνται με προεπιλεγμένες ή στοχοθετημένες πρωτεΐνες ενώ πραγματοποιούνται μη στοχευμένες πρωτεϊνωματικές διαδικασίες για να διαπιστωθούν οι τύποι πρωτεϊνών αυτού του δείγματος. Επιπλέον, η στοχευμένη πρωτεϊνωματική είναι πιο ευαίσθητη από την μη στοχευμένη πρωτεϊνωματική.

Διαφορά μεταξύ στοχοθετημένης και μη στοχευμένης πρωτεϊνωμικής σε πίνακα

Περίληψη - Στοχοθετημένη εναντίον μη προσανατολισμένων πρωτεϊνωμάτων

Συνοψίζοντας, η στοχοθετημένη και μη στοχοθετημένη πρωτεϊνωματική είναι δύο τύποι μελετών πρωτεϊνών. Όπως υποδηλώνουν τα ονόματά τους, η στοχευμένη πρωτεϊνωματική στοχεύει σε μια συγκεκριμένη πρωτεΐνη, ενώ η μη στοχευμένη πρωτεϊνωματική δεν στοχεύει σε συγκεκριμένη πρωτεΐνη Αυτή είναι η διαφορά μεταξύ στοχοθετημένης και μη στοχοθετημένης πρωτεϊομικής.

Αναφορά:

1. "στοχοθετημένη πρωτεϊνωματική." UC Davis Proteomics Core, διαθέσιμο εδώ. 2. «Πρωτεομικία / Εισαγωγή στην Πρωτεομικία». Θεωρία / τρόποι μουσικής - Wikibooks, ανοικτά βιβλία για έναν ανοιχτό κόσμο, διατίθεται εδώ.

Ευγένεια εικόνας:

1. "Proteomics" Από το Xxl7441 στα Αγγλικά Wikibooks - μεταβείτε από το en.wikibooks στο "Κοινό λεξικό (δημόσιο πεδίο)" μέσω Wikimedia Commons